Baznīcā darbojas visaptveroša mācību programma bērniem, saukta par Sākumskolu, kas dibināta 1878. gadā. Tās mērķis ir mācīt bērniem Jēzus Kristus evaņģēliju un palīdzēt viņiem dzīvot saskaņā ar evaņģēlija principiem.
Šī programma paredzēta visiem 3–11 gadus veciem bērniem, un, kamēr vecāki piedalās savās iknedēļas Baznīcas sanāksmēs, tās ietvaros katru svētdienu notiek divu stundu nodarbības. Šobrīd Sākumskolu apmeklē vairāk nekā miljons bērnu visā pasaulē.
Kopš 2016. gada aprīļa par Pēdējo Dienu Svēto Jēzus Kristus Baznīcas Sākumskolas
vispārējo prezidenti kalpo Džoja D. Džounsa (Joy D. Jones). Viņas padomnieces ir Liza Harknesa (Lisa Harkness) un Kristīna B. Franko (Cristina B. Franco).